Fort Manoel è una fortificazione dell'Isola di Malta. Esso si trova sull'isola di Gżira nel porto di Marsamxett a nord-ovest de La Valletta ed è posto a guardia dell'entrata al porto stesso e dell'ancoraggio di Sliema.
Fort Manoel è un tipico forte a stella costruito sulla viva roccia dell'isola su cui sorge. Esso venne costruito dai cavalieri di malta tra il 1723 ed il 1755 sotto il patronato del Gran Maestro portoghese Antonio Manoel de Vilhena (da cui il nome).
Il disegno originale del fortilizio sull'isola (all'epoca conosciuta col nome di "l'Isolotto") era dell'ingegnere militare francese René Jacob de Tigné, ma il disegno finale accolse delle aggiunte e dei perfezionamenti operati da Charles François de Mondion, l'ingegnere militare dell'ordine di Malta dell'epoca incaricato dei lavori di difesa e fortificazione dell'isola. Mondion inoltre supervisionò la costruzione e venne ipoteticamente sepolto nella cappella del forte, la cappella di Sant'Antonio da Padova.
Il forte fu attivo sotto i cavalieri maltesi prima e sotto l'esercito inglese poi sino al 1906 quando l'Inghilterra dichiarò ufficialmente cessata ogni sua funzione bellica.
Durante la Seconda Guerra Mondiale il forte subì alcuni danni da mombardamento aereo anche a causa dello stabilimento in loco di armi contraeree.
Attualmente il forte è oggetto di lavori di ristrutturazione che si dovrebbero concludere nel 2010.